上海社保卡与医保卡在功能和应用上存在明显差异。社保卡由人力资源和社会保障部门发行，是办理各项社保业务的综合凭证，包含医保功能但远不止于此；医保卡则仅用于医疗保险个人账户管理和就医结算，功能较为单一。社保卡采用全国统一的安全体系，支持跨省通用，并具备金融借记卡功能，而医保卡安全性和适用范围相对有限。自2018年起，医保卡逐步停用，全面过渡至功能更全面的社保卡。

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